Red Hot Chili Peppers hrají hlavně funk rock a alternativní rock, ve své tvorbě ale míchají i prvky punku, popu, psychedelie a někdy dokonce jazzu. Jejich raná alba jsou syrovější a funkovější, zatímco desky od 90. let přinášejí více melodií, balad a propracovaných aranží. Typické jsou pro ně výrazné basové linky, rytmická kytara a spojení rapovaných slok s melodickými refrény.