Repertoár The Czech Philharmonic Orchestra zahrnuje zejména českou hudbu – Dvořáka, Smetanu, Janáčka, Martinů či Sukovy a Novákovy skladby. Zároveň pravidelně uvádí velká díla světového repertoáru, od Beethovena, Brahmse a Mahlera po Stravinského, Šostakoviče či soudobé autory. Důležitou součástí jsou i premiéry nových českých skladeb a spolupráce s významnými sólisty z celého světa.